计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 量子化学 (Quantum Chemistry) › 使用windows版预编译MOKIT小程序生成GKS-EDA输入文件报 ...

使用windows版预编译MOKIT小程序生成GKS-EDA输入文件报错

查看数: 660 | 评论数: 4 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

帖子模式

yuna

发布时间: 2023-12-4 19:21

正文摘要:

各位老师好，我想使用frag_guess_wfn小程序生成GKS-EDA输入文件。已经按照手册设置了环境变量，运行时报错如下图，附件中附上了高斯的gjf输入文件，请老师帮忙看看是输入文件有问题吗？

回复 Reply

zjxitcc 发表于 Post on 2023-12-5 17:48:11

yuna 发表于 2023-12-5 17:22
您好，还想请教一个问题。
高斯gjf输入文件是放在mokit\bin文件夹下吗？我按照您说的使用文本编辑器对gj ...

只要你正确设置了MOKIT环境变量，frag_guess_wfn可以在任何目录被调用，因此gjf文件放哪里都行。如果没有（正确）设置MOKIT环境变量，那你只能试试进入mokit\bin\路径，并且把gjf文件放到这个目录下。

yuna 发表于 Post on 2023-12-5 17:22:45

zjxitcc 发表于 2023-12-5 14:01
程序报错已经解释地非常清楚了。我只能给你翻译一遍：片段中序号定义有误，该功能要求片段中原子序号要连续 ...

您好，还想请教一个问题。
高斯gjf输入文件是放在mokit\bin文件夹下吗？我按照您说的使用文本编辑器对gjf文件进行了修改，报错如下：ERROR in subroutine require_file_exist: file does not exist!
麻烦您了。

yuna 发表于 Post on 2023-12-5 15:35:25

zjxitcc 发表于 2023-12-5 14:01
程序报错已经解释地非常清楚了。我只能给你翻译一遍：片段中序号定义有误，该功能要求片段中原子序号要连续 ...

明白了，谢谢您的回复

zjxitcc 发表于 Post on 2023-12-5 14:01:03

本帖最后由 zjxitcc 于 2023-12-5 14:13 编辑

程序报错已经解释地非常清楚了。我只能给你翻译一遍：片段中序号定义有误，该功能要求片段中原子序号要连续，即片段1，片段2，片段3。不能互相穿插。
解决办法：用文本编辑器（例如Sublime Text3）打开gjf文件，把中间fragment=1的几个原子调到fragment=2前面去。

另外提醒一下，温度对GKS-EDA计算没有丝毫影响，因此写了没用；iefpcm是默认的，不用写。

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register