跑完动力学的结果很奇怪，XTC文件特别大，并且得出的RMSD结果非常稳定

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发布时间: 2023-12-5 15:23

动力学模拟完成后，生成的XTC文件特别大，大概有二十多G，并且得出的RMSD结果非常稳定，不知道是什么原因

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xiaoyana 发表于 Post on 2023-12-6 09:23:02

好的，谢谢sobereva老师

sobereva 发表于 Post on 2023-12-6 07:07:42

xiaoyana 发表于 2023-12-5 16:04
动力学模拟完成后，生成的XTC文件特别大，就是普通的蛋白和配体对接后的复合物来跑的动力学，蛋白质的氨 ...

原子数多、帧数多，轨迹文件自然会大。不会无缘无故地大

解释清楚曲线颜色的含义

sobereva 发表于 Post on 2023-12-5 15:26:02

认真看下文
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

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