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计算化学公社»论坛首页 › 理论与计算化学 (Theoretical and Computational Chemistry) › 分子模拟 (Molecular Modeling) › MGLTools 的 prepare_ligand4.py将小分子批量转为pdbqt ...

MGLTools 的 prepare_ligand4.py将小分子批量转为pdbqt格式，转出来特别奇怪...

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发布时间: 2023-12-14 18:57

正文摘要:

向各位大佬们求助用MGLTools 的 prepare_ligand4.py将小分子批量转为pdbqt格式，结果转出来了特别奇怪的东西。。。在另一篇帖子里看到sob老师说“结构明显违背基本常识，把立体结构完全当成了二维描述”。而我初始 ...

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rina_gamesh 发表于 Post on 2023-12-15 10:10:55

slxc920113 发表于 2023-12-14 22:18
用openbabel转成3d结构

感谢大佬的回复！那是直接使用gen3D转就可以了吗，还是需要进行一些其他的更精细一点的操作？

slxc920113 发表于 Post on 2023-12-14 22:18:42

用openbabel转成3d结构

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