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高斯计算阴离子脱氢的过渡态失败

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发布时间: 2023-12-14 21:32

正文摘要:

本帖最后由 wyx123 于 2023-12-14 21:32 编辑 老师好,我想设计阴阳离子(阴离子-1价 阳离子+2价)逐渐接近成单键,然后成双键同时阴离子脱氢得过程。第一步找到了单键成双键的过渡态,irc后优化得到的结构符合预 ...

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wyx123 发表于 Post on 2023-12-16 11:37:50
dnlx 发表于 2023-12-15 22:26
没做过,不知道是不是属于分子动力学模拟。

谢谢老师
dnlx 发表于 Post on 2023-12-15 22:26:43
wyx123 发表于 2023-12-15 20:30
老师 我要模拟的是沉淀物 该怎样模拟呢

没做过,不知道是不是属于分子动力学模拟。
wyx123 发表于 Post on 2023-12-15 20:30:44
dnlx 发表于 2023-12-15 12:40
你似乎在模拟这样的反应:铜离子 + 碳酸氢根 --> 碳酸铜 + 氢离子

先假定你要模拟的产物是碳酸铜 ...

老师 我要模拟的是沉淀物 该怎样模拟呢
dnlx 发表于 Post on 2023-12-15 12:40:52
本帖最后由 dnlx 于 2023-12-15 12:44 编辑

你似乎在模拟这样的反应:铜离子 + 碳酸氢根 --> 碳酸铜 + 氢离子

先假定你要模拟的产物是碳酸铜离子对,而不是碳酸铜沉淀物。否则模拟方法就错了。

如果确实模拟的是形成碳酸铜离子对:
1. 这个反应可能是两步反应,真正形成离子对的依然是碳酸根和铜离子,或者形成CuHCO3+离子、再电离出氢离子。
2. 这个反应很可能是热力学而不是动力学控制的,需要计算相关物质的热力学量,而不是寻找过渡态。
3. 应该用隐式溶剂模型,而且离子周围要加上足够个数的显式溶剂分子。

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