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请教金属配位笼的优化方法,优化过程中震荡

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发布时间: 2023-12-15 13:19

正文摘要:

本帖最后由 Tracy民工 于 2023-12-15 13:22 编辑 计算内容:我的结构是含吡咯吡啶环的有机配体和金属Zn配位形成的笼状结构,和常见的多面体笼状结构不太一样,结构如图所示。中间包合了季铵阳离子,共有348个原子 ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-12-16 23:37:39
Tracy民工 发表于 2023-12-16 09:55
谢谢sobereva老师,我当时想加了色散矫正会更难收敛,就想先低精度收敛再加色散矫正来优化,看来这种想法 ...

"加了色散矫正会更难收敛" 从来都没这回事。即便实际出现了那也只是巧合而已
Tracy民工 发表于 Post on 2023-12-16 14:21:13
GoldenBaby 发表于 2023-12-16 13:33
你这个不会是MOF里面扣出来的笼状簇模型吧。

不是呢,是MOC,cage结构。
GoldenBaby 发表于 Post on 2023-12-16 13:33:33
Tracy民工 发表于 2023-12-16 09:57
谢谢您,这已经是简化过的模型了,担心过度简化结构会不合理,我再研究研究您说的orca。

你这个不会是MOF里面扣出来的笼状簇模型吧。
Tracy民工 发表于 Post on 2023-12-16 09:57:30
GoldenBaby 发表于 2023-12-16 09:00
个人一点小建议,可以先把那些零碎的烷基链简化一下,再优化。另外不知道你用orca优化是scf不容易收敛还是 ...

谢谢您,这已经是简化过的模型了,担心过度简化结构会不合理,我再研究研究您说的orca。
Tracy民工 发表于 Post on 2023-12-16 09:55:09
sobereva 发表于 2023-12-15 20:24
弱相互作用如此显著,哪能D3都不加
好好看
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”

谢谢sobereva老师,我当时想加了色散矫正会更难收敛,就想先低精度收敛再加色散矫正来优化,看来这种想法是错误的。我再好好看看您之前的文章。
GoldenBaby 发表于 Post on 2023-12-16 09:00:34
个人一点小建议,可以先把那些零碎的烷基链简化一下,再优化。另外不知道你用orca优化是scf不容易收敛还是几何结构不收敛。按理说这种结构orca应该还挺擅长处理的。如果是scf不收敛可以尝试让orca读取Gaussian收敛的波函数再去计算。最近发现,Gaussian在几何优化收敛算法时有一点小问题,有一些结构特别容易出一些特别小的虚频,很难消掉,orca 这方面做的就要好一点(至少对于那个结构测试来说是这样)。
sobereva 发表于 Post on 2023-12-15 20:24:08
弱相互作用如此显著,哪能D3都不加
好好看
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正?”
http://sobereva.com/413http://bbs.keinsci.com/thread-9772-1-1.html
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html

看下文了解怎么帮助收敛
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

当前问题用Gaussian完全适合。换成其它程序只会更难收敛

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