qmmm计算势能面扫描结构优化不收敛

查看数: 1848 | 评论数: 3 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

llh

发布时间: 2023-12-19 22:48

本帖最后由 llh 于 2023-12-19 23:09 编辑小白求助。我在做蛋白体系的QM/MM时，采用反应坐标驱动法进行势能面扫描，从中间体结构向产物和反应物方向拉点，向反应物方向扫 ...

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2023-12-21 03:12:37

llh 发表于 2023-12-20 09:05
谢谢sob老师。这个qm/mm是程序课题组一直在用的，之前其它相似体系也是用的这个，从reac到产物拉点没有遇 ...

如果需要横向对比就需要

llh 发表于 Post on 2023-12-20 09:05:41

sobereva 发表于 2023-12-20 01:20
直接用簇模型做DFT计算就完了，没必要鼓捣这些
要善用簇模型，不要盲目用ONIOM算蛋白质-小分子相互作用问 ...

谢谢sob老师。这个qm/mm是程序课题组一直在用的，之前其它相似体系也是用的这个，从reac到产物拉点没有遇到过这么难收敛的情况。如果用簇模型的话，我其它的结构是不是也需要都重新算一遍呢。请老师指点

sobereva 发表于 Post on 2023-12-20 01:20:08

直接用簇模型做DFT计算就完了，没必要鼓捣这些
要善用簇模型，不要盲目用ONIOM算蛋白质-小分子相互作用问题
http://sobereva.com/597

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register