sobereva 发表于 2023-12-27 01:21 sob老师,好像没什么用哎,我用psmp版算5个点还是同样的报错哎,我打开了内存实时查看,一提交计算使用的内存就会急剧增加,不过就几秒的时间就报错了,这个时候内存也还剩200G左右啊。sob老师,还有k点对耗内存的影响打不打? |
科研好难 发表于 2023-12-26 21:39 前面说了,尝试psmp版 |
sob老师,我另一个帖问了您反应物,产物优化后的能量和搜索过渡态的能量不一致,您让我把相关能量的设置设成一样的,为了验证能量能否一致,我想着把7个点改成5个点,CUTOFF和REC-CUTOFF从300,35提到和优化一致的600,55,k点从1,1,1提到2,2,1验证一下,结果一提交计算还是本帖一样的报错,sob老师,256G内存5个点都算不了,是不是有点夸张了,按这个情况的话,我这个体系搜索过渡态根本就做不了,老师,您看您有什么好的建议可以帮帮我吗?属实没辙了,导师又催得紧 |
科研好难 发表于 2023-12-22 21:04 是 |
sobereva 发表于 2023-12-22 15:57 sob老师,我最后试了一下将CUTOFF和REC-CUTOFF降到300和35,总点数从9降到7,然后就已经开始计算了,这是不是说明之前的报错真的是内存不够导致的? |
sobereva 发表于 2023-12-22 16:14 好的,谢谢sob老师,我再研究研究 |
科研好难 发表于 2023-12-22 16:12 不能 参考北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)的ppt关于内存使用问题 还可以用psmp版让每个副本只用OpenMP方式并行节约内存 |
sobereva 发表于 2023-12-22 15:57 好的sob老师,那这个可以储存到硬盘里吗?服务器装了一个16TB的硬盘 |
科研好难 发表于 2023-12-22 11:48 诸如10个副本,内存消耗量就相当于跑10个独立的任务 副本多的时候内存消耗量经常甚巨,别小瞧了 |
sobereva 发表于 2023-12-21 03:38 sob老师,副点的out文件没有什么可用的信息呢,我256G的内存,应该不是内存不够的原因吧,请问老师还有什么可能的原因吗? |
看副本的out文件里的信息判断原因 |
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