求助cp2k进行AIMD模拟时CHARGE的设置

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发布时间: 2023-12-22 16:57

请问一下，我的体系是甲基丙烯酸3-磺酸丙酯钾盐和丙烯酰胺的聚合物、水、三氟甲基磺酸锌，在模拟的时候，我将K离子去掉想模拟聚合物链上的阴离子体系，然后有三个甲基丙烯酸3-磺酸丙酯钾盐单体聚合也就是相当 ...

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sobereva 发表于 Post on 2023-12-22 21:53:31

linyushuang 发表于 2023-12-22 21:45
社长，那我在建模的时候，K离子需要在聚合物上面吗？还是像盐那样，阳离子和阴离子是分两个模型用Packmol ...

K+就放在去质子化磺酸根旁边就完了

linyushuang 发表于 Post on 2023-12-22 21:45:59

sobereva 发表于 2023-12-22 21:38
若无特殊必要不建议去掉K+
要不然带负电的位点间的强烈的静电互斥会导致出现没有实际意义的动力学行为

社长，那我在建模的时候，K离子需要在聚合物上面吗？还是像盐那样，阳离子和阴离子是分两个模型用Packmol建的。让K离子在溶液中作为自由离子。

sobereva 发表于 Post on 2023-12-22 21:38:40

linyushuang 发表于 2023-12-22 20:27
社长，也就是说，我这个体系中设置-3的电荷是合理的吧，程序会自动找到能量最合理的状态。

若无特殊必要不建议去掉K+
要不然带负电的位点间的强烈的静电互斥会导致出现没有实际意义的动力学行为

linyushuang 发表于 Post on 2023-12-22 20:27:44

sobereva 发表于 2023-12-22 19:06
电荷该怎么分布自动怎么分布，SCF过程中电荷分布会自发调整到能量最低状态
实际分布情况通过算原子电荷考 ...

社长，也就是说，我这个体系中设置-3的电荷是合理的吧，程序会自动找到能量最合理的状态。

sobereva 发表于 Post on 2023-12-22 19:06:50

电荷该怎么分布自动怎么分布，SCF过程中电荷分布会自发调整到能量最低状态
实际分布情况通过算原子电荷考察

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