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径向分布函数的异常现象

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tzweir

发布时间: 2016-10-10 11:09

正文摘要:

本帖最后由 tzweir 于 2016-10-10 11:10 编辑用Amber16跑纤维素晶体的尿素水溶液模型，用的GLYCAM06j力场赋予参数。能量最小化后100ps NVT加热到298K，再150ps NPT，最后再2ns NVT作为主要的数据分析。对轨迹作 ...

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tzweir 发表于 Post on 2016-10-10 12:09:12

本帖最后由 tzweir 于 2016-10-10 12:11 编辑

好像我自己找到原因了，在进行径向分布分析之前，我加了一句rotate :0GB,4GB,ROH axis0 :91@C4 axis1 :97@C4 6.5，仅对solute作了旋转，而solvent没有被旋转，结果就全乱套了。原因很细微，但是影响非常大啊.....找了好久才找到

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