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求用VMD计算蛋白质嵌入膜内深度的脚本

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发布时间: 2023-12-23 14:10

正文摘要:

想求图里蛋白质最低点到生物膜最高点的距离

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sobereva 发表于 Post on 2023-12-24 01:09:13
VMD里输入measure minmax [atomselect top 选择语句],可以得到选择语句对应的区域的XYZ最小和最大值。对蛋白质部分和膜部分都这么测量,用膜的Z最大值减去蛋白质的Z最小值就完了。

如果不熟悉选择语句,看
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html

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