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NVT平衡后蛋白质脱离盒子,配体在盒子里

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发布时间: 2023-12-23 22:16

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任佛儿A 发表于 Post on 2023-12-25 18:25:02
sobereva 发表于 2023-12-24 21:06
参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)ppt:
...

感谢sob老师  问题解决!!!!
sobereva 发表于 Post on 2023-12-24 21:06:42
任佛儿A 发表于 2023-12-24 12:25
感谢sob老师,但是我对代码命令这方面不是很了解,您能展开说一下具体操作过程吗  非常感谢!

参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)ppt:
把里面-pbc mol改成-pbc res

任佛儿A 发表于 Post on 2023-12-24 12:25:26
sobereva 发表于 2023-12-24 01:06
trjconv接上-pbc res转换轨迹,保持残基的完整性

感谢sob老师,但是我对代码命令这方面不是很了解,您能展开说一下具体操作过程吗  非常感谢!
sobereva 发表于 Post on 2023-12-24 01:06:16
trjconv接上-pbc res转换轨迹,保持残基的完整性

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