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碳纳米管拼接高斯优化问题怎么解决？

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许豪铭

发布时间: 2024-1-3 14:34

正文摘要:

本帖最后由许豪铭于 2024-1-3 14:41 编辑 ****************************************** Gaussian 09: IA32W-G09RevC.01 23-Sep-2011 &nb ...

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许豪铭 发表于 Post on 2024-1-4 13:10:49

sobereva 发表于 2024-1-4 09:59
先确保gview里看到的键连关系都合理，不合理就改合理了，然后保存成含有键连关系的mol2文件。之后用openbab ...

感谢sob老师

sobereva 发表于 Post on 2024-1-4 09:59:53

先确保gview里看到的键连关系都合理，不合理就改合理了，然后保存成含有键连关系的mol2文件。之后用openbabel、avogadro等免费程序都可以做基于分子力场的几何优化。用Gaussian基于UFF力场也可以

许豪铭 发表于 Post on 2024-1-3 17:01:26

zjxitcc 发表于 2024-1-3 16:13
经典力场

老师您好，用什么软件的经典力场来优化呀

zjxitcc 发表于 Post on 2024-1-3 16:13:59

许豪铭发表于 2024-1-3 15:10
老师您好，那您有什么建议可以优化拼接碳纳米管呀？

经典力场

许豪铭 发表于 Post on 2024-1-3 15:10:01

zjxitcc 发表于 2024-1-3 14:54
（1）b3lyp/6-31g(d)算不动这么大的体系，用任何程序都这样，不止Gaussian；（2）你用的是32位Win版Gaussia ...

老师您好，那您有什么建议可以优化拼接碳纳米管呀？

zjxitcc 发表于 Post on 2024-1-3 14:54:30

（1）b3lyp/6-31g(d)算不动这么大的体系，用任何程序都这样，不止Gaussian；（2）你用的是32位Win版Gaussian，上限只能用4核1GB的资源，这在b3lyp/6-31g(d)下只能算十几个原子。当然，即使你把程序换成64位Linux版Gaussian，也逃不脱（1）的限定。

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