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PSI4做能量分解报错求助

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发布时间: 2023-12-26 11:13

正文摘要:

各位老师,我用sob老师经验贴 http://sobereva.com/526 使用PSI4做对称匹配微扰理论(SAPT)能量分解计算,安装了PSI4程序,运行后出现报错,查了论坛帖子可能是内存不够这里粘上虚拟机的设置,想请教大家我这个大概80 ...

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2532251334 发表于 Post on 2023-12-28 21:41:26
zjxitcc 发表于 2023-12-27 22:51
我仍然坚持是你 PSI4临时文件所在的分区太小 (注意,整个Linux系统有多大,与目标分区有多大,是两码事 ...

好的,谢谢老师解答,我再试试。
zjxitcc 发表于 Post on 2023-12-27 22:51:00
本帖最后由 zjxitcc 于 2023-12-27 22:52 编辑
2532251334 发表于 2023-12-26 17:08
老师我确认过了,是内存不够无法运行。后来我重新撞了个虚拟机分了很大的物理内存,然后用64G(电脑的极限 ...

我仍然坚持是你 PSI4临时文件所在的分区太小 (注意,整个Linux系统有多大,与目标分区有多大,是两码事)
2532251334 发表于 Post on 2023-12-27 14:20:25
sobereva 发表于 2023-12-26 23:37
这么大体系做SAPT极其占用资源,而且只能用最低阶的SAPT0,精度挺烂的
强烈建议用sobEDAw代替,不怎么占内 ...

老师我看到您的帖子了,我想求电荷转移项的成份,不知道您有写教程没?我好像没看到
sobereva 发表于 Post on 2023-12-26 23:37:00
这么大体系做SAPT极其占用资源,而且只能用最低阶的SAPT0,精度挺烂的
强烈建议用sobEDAw代替,不怎么占内存和硬盘,耗时低得多,精度也比SAPT0更好
使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html
2532251334 发表于 Post on 2023-12-26 17:08:54
zjxitcc 发表于 2023-12-26 14:33
在2L中已经说过了“检查一下临时文件所在目录”。手把手教学举例:
运行df -h查看所有分区,检查有无分 ...

老师我确认过了,是内存不够无法运行。后来我重新撞了个虚拟机分了很大的物理内存,然后用64G(电脑的极限)内存运行不会报错但是到后面内存一直99%占用但是CPU只有1%,换成32G内存后,运行到一半直接Killed任务就结束了,也没有报错,老师您知道咋回事吗?是不是我电脑算不了这个?
zjxitcc 发表于 Post on 2023-12-26 14:33:00
2532251334 发表于 2023-12-26 12:02
您好感谢回复,我的虚拟机大概只剩不到20个g,是不是临时文件写不下了。

在2L中已经说过了“检查一下临时文件所在目录”。手把手教学举例:
运行df -h查看所有分区,检查有无分区几乎被写满了,是否其含有$PSI_SCRATCH/目录。
若某个分区中目录较多,不知道哪个目录占用最多,可进入相应目录,运行du -h --max-depth=1查看哪个目录占用最多。
2532251334 发表于 Post on 2023-12-26 12:02:31
zjxitcc 发表于 2023-12-26 11:30
你这不像是内存不足,像是硬盘分区写满了,临时文件太大了。检查一下临时文件所在目录。如果你有设置$PSI_S ...

您好感谢回复,我的虚拟机大概只剩不到20个g,是不是临时文件写不下了。
zjxitcc 发表于 Post on 2023-12-26 11:30:52
你这不像是内存不足,像是硬盘分区写满了,临时文件太大了。检查一下临时文件所在目录。如果你有设置$PSI_SCRATCH环境变量的话,那就在$PSI_SCRATCH/下。Windows下装虚拟机然后装Linux系统是一种办法,不过我个人不推荐虚拟机,建议直接使用Win10和11自带的Linux子系统WSL(需要开启WSL,网上教程一箩筐)。

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