Gaussian根本没法计算净电荷不为整数的情况,这是基本常识 |
sobereva 发表于 2023-12-30 05:36 好的,老师,就是我用Multiwfn懒人教程运行时,输入“./Resp.sh 1.pdb -0.0638 1 water”没办法运行程序,但是如果我把电荷数改成-1,是可以正常运行的。我是想问,这个程序没办法算非整数电荷的分子基团的RESP吗 |
zhijiu 发表于 2023-12-29 16:35 说清楚什么命令、往哪里输入、什么程序,完全不知道你说的是什么情况。提问时主动把问题交代完整,仔细看此文 在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚 http://sobereva.com/620(http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html) |
本帖最后由 zhijiu 于 2023-12-29 18:07 编辑 sobereva 发表于 2023-12-29 04:15 好的,谢谢老师。还有一个问题,就是我输入的结构电荷总数是-0.0631,我命令行输入的时候,程序没办法运行,电荷只能输入整数吗? |
zhijiu 发表于 2023-12-28 22:11 你的体系里真的有Ho元素? 如果你的pdb文件里不含元素信息,Multiwfn会根据原子名自动猜元素,很可能猜不对,诸如HO可能本身是氢的原子名,但Multiwfn以为是Ho |
sobereva 发表于 2023-12-28 20:57 好的,谢谢老师,我把脚本改正后,报了别的错,“Atomic number out of range in def2SV”,这是什么原因? |
不要自己在标题里手写【求助】这种标签,http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给你改了,以后注意 计算RESP原子电荷的超级懒人脚本(一行命令就算出结果) http://sobereva.com/476(http://bbs.keinsci.com/thread-12858-1-1.html) 此文明确说了 注意Gaussian09 D.01版本之前不支持DFT-D3校正,因此用老版本者应当把脚本里em=GD3BJ关键词取消,相关信息看《DFT-D色散校正的使用》(http://sobereva.com/210)。 |
是你的Gaussian版本太低了 |
手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图
GMT+8, 2025-8-16 00:13 , Processed in 0.225662 second(s), 25 queries , Gzip On.