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利用软势修正低精度大型蛋白模型的原子重叠问题一例

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发布时间: 2024-1-2 00:19

正文摘要:

本帖最后由 Graphite 于 2024-1-2 11:21 编辑 利用软势修正低精度大型蛋白模型的原子重叠问题一例 石墨 首发计算化学公社     在预处理一些大型、柔性模型时,会遇到表现为”bad contact”、”inf( ...

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Graphite 发表于 Post on 2025-7-28 13:19:28
Sync 发表于 2025-7-28 11:53
我用gromacs的软心势跑高分子体系(类似于文中的4的用法),跑完之后想切换到正常的力场再跑模拟,结果遇到 ...

那个形式和用途上和这个cosine函数不是一回事
Sync 发表于 Post on 2025-7-28 11:53:28
我用gromacs的软心势跑高分子体系(类似于文中的4的用法),跑完之后想切换到正常的力场再跑模拟,结果遇到这个原子重叠的情况

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