关于反应寻找过渡态寻求建议与指正

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发布时间: 2024-1-2 16:18

我的反应机理推断中，有如下两个关键步骤。我的计算是M06-2X/6-311+G**下做的，虽然反应物是液体，但未外加溶剂，计算时没有加溶剂模型（开始算时反应物的介电常数没找到，师兄表示无伤大雅）。问题1：A-B这一步其 ...

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xiaowoniu1992 发表于 Post on 2024-1-3 16:55:38

dnlx 发表于 2024-1-2 21:47
如果溶剂是醇类，仍然需要加显式溶剂来稳定氢氧根。

如果确实可以模拟为这样的气态反应，质子转移（A到B ...

感谢老师的指教！那这两个过渡态我就不找了吧。不然硬找到了与实验相悖的，也不好处理

dnlx 发表于 Post on 2024-1-2 21:47:48

如果溶剂是醇类，仍然需要加显式溶剂来稳定氢氧根。

如果确实可以模拟为这样的气态反应，质子转移（A到B、C到D）有可能不存在过渡态。

因为D的负电荷并非固定在你画的那个碳原子上，而是部分位于左环最下面的碳原子，所以D到E也是个水到有机分子的质子转移反应，不应该有很高的能垒。

xiaowoniu1992 发表于 Post on 2024-1-2 20:52:10

本帖最后由 xiaowoniu1992 于 2024-1-2 20:54 编辑

sai77 发表于 2024-1-2 19:56
亚甲基的两根sigma键反正可以自由旋转，可以转到两个羰基靠近的构象作为中间体
那从B到C的过渡态呢？Ald ...

它们可以自由旋转，然而由于整个体系带有一个负电荷，根据过渡态计算出的高能量，我推测可能它旋转到两个氧挨得很近的情况需要的能量可能很大

关于后面的问题，B到C就是我自己的研究得课题，现在还不太方便透漏，不好意思

sai77 发表于 Post on 2024-1-2 19:56:13

xiaowoniu1992 发表于 2024-1-2 19:36
两个氧离得很开，计算找到的过渡态和反应物及产物的差值太大，有0.1个hartree，所以舍弃了

亚甲基的两根sigma键反正可以自由旋转，可以转到两个羰基靠近的构象作为中间体
那从B到C的过渡态呢？Aldol反应不加碱能发生？

xiaowoniu1992 发表于 Post on 2024-1-2 19:36:16

sai77 发表于 2024-1-2 19:02
为什么要先A质子化到B，C再去质子化到D这么麻烦？为什么不能直接从A到D？这不就是Aldol反应吗？

两个氧离得很开，计算找到的过渡态和反应物及产物的差值太大，有0.1个hartree，所以舍弃了

sai77 发表于 Post on 2024-1-2 19:02:14

本帖最后由 sai77 于 2024-1-2 19:03 编辑

为什么要先A质子化到B，C再去质子化到D这么麻烦？为什么不能直接从A到D？这不就是Aldol反应吗？

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