求助：锂离子电池电解液溶剂化结构模拟

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xjw

发布时间: 2024-1-2 21:20

本帖最后由 xjw 于 2024-1-3 08:42 编辑各位老师好，我利用Gromacs模拟电池电解液中锂离子的溶剂化结构，使用的是Amber力场（利用卢老师sobtop生成的），然后采用RESP2电荷，使用的结构优化输入文件和10ns的NPT ...

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xjw 发表于 Post on 2026-4-29 23:13:54

Hanna110 发表于 2025-10-24 19:52
用gaff2生成itp文件可解决

请问GAFF2立场文件怎么生成的呢

xjw 发表于 Post on 2026-4-29 23:13:19

Hanna110 发表于 2025-10-9 19:58
请问这个快照是截图vmd中的某一帧吗？还是根据gromacs指令选出来的呢？

就是。gro文件

Hanna110 发表于 Post on 2025-10-24 19:52:50

Free-standing 发表于 2024-4-2 22:22
老哥，这个问题解决了嘛，我也遇到了同样的问题，感觉锂离子用KBFF的力场感觉还是有聚集

用gaff2生成itp文件可解决

Hanna110 发表于 Post on 2025-10-9 19:58:36

请问这个快照是截图vmd中的某一帧吗？还是根据gromacs指令选出来的呢？

研研研 发表于 Post on 2025-6-25 20:45:20

请问这个问题解决了吗？我是初学者，最近也遇到聚集的问题了，换锂离子力场的方法能解决问题吗

xjw 发表于 Post on 2024-11-30 18:33:35

gyp 发表于 2024-11-17 01:28
请问聚集的问题现在解决了吗

可以用卢老师的方法试试，也就是2楼

gyp 发表于 Post on 2024-11-17 01:28:32

xjw 发表于 2024-7-28 08:54
就是快照里面阴阳离子聚集在一起

请问聚集的问题现在解决了吗

xjw 发表于 Post on 2024-7-28 08:54:37

JunS 发表于 2024-7-23 14:28
请问下这种会聚集的状态是不是径向分布函数出来的图峰比较尖？遇到了类似的问题

就是快照里面阴阳离子聚集在一起

JunS 发表于 Post on 2024-7-23 14:28:21

请问下这种会聚集的状态是不是径向分布函数出来的图峰比较尖？遇到了类似的问题

xjw 发表于 Post on 2024-4-10 09:56:02

Free-standing 发表于 2024-4-2 22:22
老哥，这个问题解决了嘛，我也遇到了同样的问题，感觉锂离子用KBFF的力场感觉还是有聚集

确实，还是聚集的状态

Free-standing 发表于 Post on 2024-4-2 22:22:13

老哥，这个问题解决了嘛，我也遇到了同样的问题，感觉锂离子用KBFF的力场感觉还是有聚集

sobereva 发表于 Post on 2024-3-20 23:28:41

xjw 发表于 2024-3-18 17:06
老师，我想问下KBFF力场中锂离子的参数需要进一步处理吗？类似下图，还是说可以直接使用呢？

直接用

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