求助gromacs模拟解金属离子对蛋白与配体结合的结果分析的问题

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发布时间: 2024-1-5 11:39

各位老师好，最近在分子动力学模拟过程中遇到了一些问题想请教一下。就是想通过在模拟系统当中添加不同的金属离子，来了解金属离子对蛋白与配体结合的影响，模拟系统中包括蛋白，金属离子，配体小分子。蛋白质用的 ...

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username 发表于 Post on 2025-5-30 18:21:24

同学你好，金属离子你是怎么配力场？

Azrael 发表于 Post on 2024-1-22 15:22:49

既然有时间重复跑，不如跑时间长一些，比如跑200ns，观察RMSD是否收敛。50ns很难说明带金属的复杂体系

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