GROMACS跑完蛋白质配体复合物Rg增大

查看数: 570 | 评论数: 2 | 收藏 Add to favorites 0

关灯 | 提示：支持键盘翻页<-左右->

发布时间: 2024-1-6 15:18

想请问一下各位老师和大神：黑色是游离的蛋白，蓝色是蛋白和配体的复合物，复合物的RMSD与Rg均在增大，这个现象有比较合理的解释吗，另外这个RMSD需要续跑吗？

回复 Reply

Huschein 发表于 Post on 2024-1-6 18:43:03

结合之后变大是吧，考虑一下变构效应吧

sobereva 发表于 Post on 2024-1-6 18:33:02

解释RMSD变化这种问题一律结合轨迹去分析，看轨迹动画、绘制轨迹多帧叠加图等。光看这曲线谁也说不准

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register