如果你只是想让自己、或者导出的图片更符合你的直觉的话，就把NHC卡宾碳旁边的两个键设定成partial double bond键完全可以接受，大家都知道是什么意思。当然实际上这如楼上所说，没什么意义。

任何图形可视化软件显示的都只是原子之间的“连接方式”，不是化学键。不要被看到的图给误导了。
图形可视化软件是根据默认的原子间距来判断所谓的“单键”、“双键”、“三键”，你改变原子间的距离，所呈现出来的所谓“化学键”就会变化。

对于量子化学计算，第一性原理计算，这些所谓的“化学键”有没有，都不会影响计算结果。所以，不用纠结什么“单键”、“双键”。

说得更极端一些，根本没有什么化学键。化学键只是化学家为了形象描述分子结构想象出来的。本质上是电子在原子核周围的运动状态。

把此文看了
谈谈原子间是否成键的判断问题
http://sobereva.com/414（http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html）

可视化程序里设成几重键完全不影响量子化学计算

软件显示就是根据键长判断的。优化后再看看键长这些是不是需要的