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计算能垒路径时,得到的自由能都大于0,计算结果合理吗

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发布时间: 2024-1-21 04:10

正文摘要:

本帖最后由 Zyyyy 于 2024-1-21 04:11 编辑 整个体系都是主族元素,没有金属。能垒路径上所有的结构优化都是使用的B3LYP-D3(BJ)/6-311+G**,单点能计算时使用的是M06-2X-D3/ma-def-TZVP,使用Shermo程序对体系能 ...

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Zyyyy 发表于 Post on 2024-1-25 15:31:02
wzkchem5 发表于 2024-1-24 20:33
因为计算算的是标准自由能,也就是标准浓度(溶液是1mol/L,气体是1bar)下这个分子的自由能,而不是实际 ...

好的 好的~~谢谢老师~
wzkchem5 发表于 Post on 2024-1-24 20:33:23
Zyyyy 发表于 2024-1-24 07:35
我老师说 这个结果不遵循最小自由能原理 认为所有必须中间体的自由能都要比INT0小 反应才能自发进行 否则 ...

因为计算算的是标准自由能,也就是标准浓度(溶液是1mol/L,气体是1bar)下这个分子的自由能,而不是实际浓度下的自由能。标准自由能不满足最小自由能原理,必须做浓度校正以后,变成实际浓度下的自由能才满足。
你老师是忽略了“计算化学里标准自由能的标准两字经常省略”,直接拿咱们口头上说的自由能(其实是标准自由能)去套物化课本上的自由能(实际浓度下的自由能)的性质,所以得到了错误的结论。如果跟老师讲道理说不过,随便找三篇JACS及以上的、涉及至少一个中间体的自由能高于反应物的文章,10篇带计算的有机文章里找3篇这样的文章很容易。然后用事实说话就行了
Zyyyy 发表于 Post on 2024-1-24 14:35:59
wzkchem5 发表于 2024-1-22 16:31
那是你看的文献不够多。
做科研切忌靠“和文献是否相似”来判断自己的结果是否合理,而是要从原理判断。 ...

我老师说 这个结果不遵循最小自由能原理 认为所有必须中间体的自由能都要比INT0小 反应才能自发进行 否则这个模拟计算不合理的 我不知道怎么跟老师解释
Huschein 发表于 Post on 2024-1-22 19:24:56
还好吧,至少看起来数值上都还算合理
wzkchem5 发表于 Post on 2024-1-22 16:31:06
Zyyyy 发表于 2024-1-22 03:26
因为很多文献都是的中间过程这些 都是小于零的 对于我自己的数据有点不自信 想问问 这样的反应路径时合理 ...

那是你看的文献不够多。
做科研切忌靠“和文献是否相似”来判断自己的结果是否合理,而是要从原理判断。如果从原理上找不出来中间体自由能不能全大于0的理由,那就是没问题
Zyyyy 发表于 Post on 2024-1-22 10:26:35
wzkchem5 发表于 2024-1-21 18:49
什么叫得到的自由能都大于0?最后产物的自由能小于0锕

因为很多文献都是的中间过程这些 都是小于零的 对于我自己的数据有点不自信 想问问 这样的反应路径时合理的吗
wzkchem5 发表于 Post on 2024-1-21 18:49:27
什么叫得到的自由能都大于0?最后产物的自由能小于0锕

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