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MS构建amorphous cell时,如何确保所建结构中包含氢键

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发布时间: 2024-1-22 13:42

正文摘要:

如图所示,假设水杨酸与三聚氰胺通过氢键连接。在建立amorphous cell的过程中,我手动将距离限制在3.5A以内,假使它形成了如图所示的氢键。之后通过ms的amorphous cell tool将它构建为amorphous结构。但在几何优 ...

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chenzhe 发表于 Post on 2024-1-23 10:57:54
氢键是靠后续分子动力学稳定后统计的,就算你这样加进去,分子动力学一算也不是这样,完全没必要。直接单组分放进去就是了

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