求助：退火后怎么样将继续优化蛋白质结构

正文摘要:

想请教一下各位老师，我做MD模拟的目的是为了优化蛋白质结构。之前是直接跑完100ns的MD后选择能量最低的一帧输出（体系达到平衡），但是在进行模型检验的时候，模型的VERIFY 3D值没有达到要求，只有49%（要求是＞80% ...