CP2K晶体结构优化变形扭曲

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发布时间: 2024-1-31 19:28

老师好，自己合成制备了一个分子，目前没有标准的cif文件，但寻找文献找到了一个类似的，在此基础上自己用Gaussview替换掉了周围的六元环，在CP2K上做结构优化，由于是自己手动修改的，替换的五元环部分坐标应该失 ...

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WenqiHan 发表于 Post on 2024-2-1 11:10:13

sobereva 发表于 2024-2-1 04:07
1 一般不可行，结构的稍微改变都可能明显影响实际晶体结构，只是自己手动修改一下然后重新优化体系的话，很 ...

谢谢社长解答，那我就不在上面费功夫了

sobereva 发表于 Post on 2024-2-1 04:07:32

1 一般不可行，结构的稍微改变都可能明显影响实际晶体结构，只是自己手动修改一下然后重新优化体系的话，很可能得到的只是能量较高的亚稳态晶体结构。

2 语义不明。又不是算孤立体系，跟Gaussian没关系

3 VESTA的显示问题，多显示出了镜像而已。用Multiwfn或gview显示没这个问题

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