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求助关于分子与原子间的键解离能

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发布时间: 2024-2-1 08:52

正文摘要:

各位老师好,请问nwchem可以计算分子与原子间的键解离能吗,比如氨基酸和金属的组合,从构型上看金属可能只是与其中一到三个原子有作用,双原子看了之前一位老师的能算出来,但这种情况不知道能不能算,希望各位老师 ...

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Joy-bomin 发表于 Post on 2024-2-2 10:00:31
sobereva 发表于 2024-2-2 01:51
用NWChem做SODFT在DFT计算中考虑旋轨耦合效应
http://sobereva.com/368(http://bbs.keinsci.com/thread ...

谢谢老师的回复,我去试试
sobereva 发表于 Post on 2024-2-2 01:51:45
Joy-bomin 发表于 2024-2-1 09:53
谢谢老师回复,灰色金属是铅,因为考虑到是重金属,所以想加入SOC,算加入旋轨耦合和未加入的做对比,目 ...

用NWChem做SODFT在DFT计算中考虑旋轨耦合效应
http://sobereva.com/368http://bbs.keinsci.com/thread-5573-1-1.html

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Joy-bomin 发表于 Post on 2024-2-1 09:53:02
sobereva 发表于 2024-2-1 09:02
可以算

不知道当前灰色的是什么金属。如果是过渡金属,算这种问题应该用与真实存在形态尽可能相符的模型 ...

谢谢老师回复,灰色金属是铅,因为考虑到是重金属,所以想加入SOC,算加入旋轨耦合和未加入的做对比,目前就只有单个氨基酸和重金属,用的隐式溶剂水模型,后面会考虑老师所说的显式溶剂分子
PS:还有老师所提到的还有别的氨基酸的形式,我理解的是氨基酸成簇的形式(不知道对不对),目前实验中已经获得了氨基酸成簇,还有由于金属催化脱水成肽的质谱和光电能谱数据,现在在配合计算寻找路径,不过暂时卡在了不知道为什么一加过渡金属优化就进行不下去,收敛不了的情况,还在寻找原因
所以目前想先解决单个氨基酸和重金属键解离能,考虑旋轨耦合前后的情况,但不太懂应该怎么编写输入文件,希望老师可以提点一下,谢谢您了
sobereva 发表于 Post on 2024-2-1 09:02:49
可以算

不知道当前灰色的是什么金属。如果是过渡金属,算这种问题应该用与真实存在形态尽可能相符的模型,空着的地方还应该有氨基酸或者溶剂分子与之配位

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