求助：sobtop选择原子类型时报错

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发布时间: 2024-2-2 17:14

只有选择（1）时不报错，选择（2）（3）（4）时会出现跟下图相似错误，sobtop在ubuntu系统下运行。

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MGRACE 发表于 Post on 2024-2-3 12:04:42

sobereva 发表于 2024-2-3 06:14
载入文件时的路径不要出现~，这仅在shell里才认，程序里不认

谢谢社长解决了

sobereva 发表于 Post on 2024-2-3 06:14:34

载入文件时的路径不要出现~，这仅在shell里才认，程序里不认

丁越 发表于 Post on 2024-2-2 21:03:26

你给atomtype程序添加可执行权限了么？

另外产生mol2文件的时候推荐用OpenBabel，它产生的mol2文件格式比较规范，产生完了最后拖到Gaussview中看一眼有没有问题。
格式转化执行命令：obabel inpfile -O outfile

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