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发布时间: 2024-2-3 21:36
正文摘要:本帖最后由 TwilyAbyss 于 2024-2-3 22:26 编辑 各位老师们好。想请教一个问题，我想要计算如下一个稀土化合物，中心离子是Ho(III)，三个配体其中有两个是视黄酸阴离子，一个是视黄酸阴离子自由基。总共147个原子 ... |
wzkchem5 发表于 2024-2-17 16:13 好的，非常感谢老师！ |
TwilyAbyss 发表于 2024-2-17 07:20 只要Au团簇取得足够大就可以。除了Au团簇的大小要求外，个人建议Au的原子数最好是偶数，这样Au团簇整体是闭壳层的，相比开壳层的Au团簇更能反映体相Au的真实电子结构 |
wzkchem5 发表于 2024-2-6 17:44 老师您好！不好意思把这个旧帖子翻出来了。想问一下您这里说的（1）中的情况，我可以在Gaussian中做BS-DFT时考虑Au基底的作用吗？（我的想法是截取一小块Au(111)面和稀土配合物靠近摆放，把这样一个结构拿去单点计算）或者有什么更精确的方法呢？恳请老师指教！ |
wzkchem5 发表于 2024-2-6 17:44 好的，谢谢老师！ |
TwilyAbyss 发表于 2024-2-6 07:05 Au表面上配位数会低，这个没问题，但是得注意以下问题：（1）Ho离子和Au基底的电子结构的相互影响很可能不可忽略，在气相里优化的结构未必能代表表面的情况；（2）类似地，视黄酸上如果有单电子，也很可能和金基底有强烈作用，例如发生成键或电子转移；（3）最好确认实验上是否已知Ho上没有其他配体，如果Ho上配了其他小配体，比如一两个水分子，很多表征手段表征不出来 |
wzkchem5 发表于 2024-2-6 03:47 感谢老师的解答！其实这个结构不是我们自己优化的，是其他课题组给我们的，说是在Au(111)表面上优化的结构，所以会呈现这种配位数低的三配位，然后让我们拿这个结构在气相中计算单点 |
| 最大问题是，除非配体位阻极其大，否则稀土在一般溶剂里不可能是三配位。首先羧基有可能采取kappa-2配位；其次溶剂但凡有一点配位性，必然会有很多溶剂和稀土配位，往往让稀土的配位数增加到9~10左右。 |
sobereva 发表于 2024-2-4 04:54 好的，非常感谢sob老师！ |
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尝试PBE0-D3(BJ)、MN15 注意溶剂效应的考虑 单电子不存在那种相加的关系，诸如甲基自由基有一个单电子，显然不意味着两个甲基自由基结合形成的乙烷有两个单电子。不同自旋态可以都做计算比较能量 考虑形成更高配位数的可能。进行试算过程中可以把配体简化以大幅节约时间，即截短烃链。 |
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