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Rocky Linux 9.3系统安装及Gromacs, Gaussian, xtb, ORCA, SVM等程序安装

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发布时间: 2024-2-8 14:56

正文摘要:

本帖最后由 欢乐多 于 2025-7-2 17:15 编辑 Rocky Linux 9.3系统安装及Gromacs,Gaussian, xtb, ORCA, SVM等程序安装前言笔者曾撰写《Centos stream 9 安装Gromacs 2023.1(GPU加速版)教程》和《我对计算化学的探 ...

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z1065480896 发表于 Post on 2024-12-31 10:43:10

好的,谢谢,已经成功。
欢乐多 发表于 Post on 2024-12-31 04:48:10
z1065480896 发表于 2024-12-26 01:55
准备gpu加速gromacs,最近按显卡型号装了个niadia 驱动是550版本,结果cuda版本是12.6——显示驱动得560版 ...

两种方法都可以
z1065480896 发表于 Post on 2024-12-26 17:55:55
准备gpu加速gromacs,最近按显卡型号装了个niadia 驱动是550版本,结果cuda版本是12.6——显示驱动得560版本才能运行。驱动已经安装好了,请问我是得重新卸载驱动重新装,还是找一个12.5版本cuda,还是两种方法都可以?
动力学 发表于 Post on 2024-9-16 20:38:33
欢乐多 发表于 2024-9-15 02:38
需要装上cuda,并且编译的gromacs能用GPU加速

好滴好滴 多谢多谢
欢乐多 发表于 Post on 2024-9-15 02:38:52
动力学 发表于 2024-9-9 00:52
您好楼主,请问您装上后,gromacs跑的会很快嘛 为什么我的4090装上以后还不如3080跑的任务速度快呀

需要装上cuda,并且编译的gromacs能用GPU加速
动力学 发表于 Post on 2024-9-9 16:52:13
您好楼主,请问您装上后,gromacs跑的会很快嘛 为什么我的4090装上以后还不如3080跑的任务速度快呀
fwz3888 发表于 Post on 2024-8-30 12:49:36
非常详细的教程 感谢楼主
欢乐多 发表于 Post on 2024-7-26 00:33:09
Zoeycta 发表于 2024-7-24 17:11
楼主你好,请问安装了辅助GROMACS2018.8版本之后,默认运行的是哪一版的呢?某次模拟如果特意想用其中一版 ...

在系统环境变量里.bashrc用#注释掉不想用的版本就行,比如下是只能用2024.1
source /root/soft/gmx_GPU_2024.1/bin/GMXRC
#source /root/soft/gmx_noGPU_2018.6/bin/GMXRC
不过2018年版本和以前的不太容易在Centos 9.3安装
Zoeycta 发表于 Post on 2024-7-25 09:11:14
楼主你好,请问安装了辅助GROMACS2018.8版本之后,默认运行的是哪一版的呢?某次模拟如果特意想用其中一版本的,该如何调用呢?
chemicalchange 发表于 Post on 2024-7-17 08:44:26
欢乐多 发表于 2024-7-17 01:19
是一个软件SVM的脚本需要这个环境支持

我把SVM-M的脚本带module的注释了然后q16都改成g16,单机用起来似乎没什么问题。
欢乐多 发表于 Post on 2024-7-17 01:19:36
chemicalchange 发表于 2024-7-13 22:10
module python是不是集群需要的?把带module的删了好像也可以用。

是一个软件SVM的脚本需要这个环境支持
chemicalchange 发表于 Post on 2024-7-14 14:10:01
module python是不是集群需要的?把带module的删了好像也可以用。
aikeyin 发表于 Post on 2024-7-13 21:56:57
99的小羊 发表于 2024-7-13 21:40
我参考了楼主的方法,装Rocky Linux9.4没有问题

谢谢大佬
99的小羊 发表于 Post on 2024-7-13 21:40:48
aikeyin 发表于 2024-7-11 19:47
请问大佬,这个教程适用于Rocky Linux9.4吗?

我参考了楼主的方法,装Rocky Linux9.4没有问题

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