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关于绘制Hirshfeld surfaces和Fingerprint plot的几点问题？

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本主题由 sobereva 于 2024-2-14 11:36 分类

L228870573

发布时间: 2024-2-14 09:56

正文摘要:

图1:

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sobereva 发表于 Post on 2024-2-15 13:53:07

L228870573 发表于 2024-2-14 19:06
可是这并不是晶体，不是周期性结构，就是一对离子和CO2，这样怎么能绘制出来这种闭合的效果呢

原理上没法实现。图上明显能看出边界有棱有角，不像是孤立体系的情况

参考下文里的孤立体系的Hirshfeld surface都是什么样的
使用Multiwfn做Hirshfeld surface分析直观展现分子晶体和复合物中的相互作用
http://sobereva.com/701（http://bbs.keinsci.com/thread-43178-1-1.html）

L228870573 发表于 Post on 2024-2-14 19:06:43

sobereva 发表于 2024-2-14 12:18
文献里可能是从晶体中抠出来的簇绘制的，并且作图时将簇的部分分子隐去了

就是按Multiwfn手册里说的绘制

可是这并不是晶体，不是周期性结构，就是一对离子和CO2，这样怎么能绘制出来这种闭合的效果呢

sobereva 发表于 Post on 2024-2-14 12:18:40

文献里可能是从晶体中抠出来的簇绘制的，并且作图时将簇的部分分子隐去了

就是按Multiwfn手册里说的绘制

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