wzkchem5 发表于 2025-6-25 12:16 好的,感谢老师! |
Xx_DerEnTh 发表于 2025-6-25 12:00 非常正常,说明这个反应在有垒和无垒的边缘。 无论哪种情况,都意味着(1)逆反应的速率极其快;(2)要把逆反应的速率算准,不能用过渡态理论,必须用AIMD等方法。所以不用纠结这个过渡态到底是否存在 |
wzkchem5 发表于 2024-2-28 17:23 老师您好!我有一个体系,用DFT优化过后,反应复合物到过渡态有明显的势垒,过渡态电子能量比产物复合物的电子能量高一丝(两者电子能量基本持平,但还是过渡态电子能量更高),我跑了IRC这个过渡态能够连接反应复合物和产物复合物,然后我用后HF结合高精度基组算单点能后,过渡态电子能量比产物复合物电子能量低一丝(也是基本持平,但产物复合物的电子能量高),请教老师这种情况是正常的吗? |
jsczfx 发表于 2024-3-14 11:38 正常,说明这个反应在有垒和无垒的边缘。一定要搞清楚有没有能垒的话,得把结构优化理论级别提高到和单点能级别一致,再优化看看。不过一般没有必要搞清楚,因为不管能垒是特别小的非零值还是为0,过渡态理论都不可靠,只能说反应很快,而无法由能垒计算得到靠谱的速率常数,必须用AIMD、VRC-TST等方法。 |
wzkchem5 发表于 2024-2-28 17:23 老师好,我也遇到了类似的问题,并尝试做了对比,发现过渡态的自由能都低于反应物(无论是两个反应物单体能量之和还是反应复合物),如图(单位hartree)。 IRC也跑了,但能量差只有-0.000222Hartree 请问这种情况也是正常的吗?即说明这个反应能垒很低,在校正中由于计算方法的误差导致了出现这种情况,又或者是说明该反应是个无势垒过程? ![]() |
wzkchem5 发表于 2024-2-28 17:23 明白了 谢谢老师您的解答 |
sai77 发表于 2024-2-28 01:45 如果算单点能的级别和结构优化的级别不同,那么本来就有可能反应物/产物的自由能或能量比过渡态高。 但如果单点能的级别和结构优化的级别相同,而且跑了IRC确认反应物和产物确实是正确的,那么数学上不可能出现这种现象。IRC表明能量一路下坡,结果能量反倒比一开始高了,显然不可能 |
sai77 发表于 2024-2-28 10:29 谢谢您 |
Lzw1281 发表于 2024-2-28 10:06 10.1021/jacs.1c01366 |
sai77 发表于 2024-2-28 08:45 您好 可以发一下这篇文章的链接吗? |
wzkchem5 发表于 2024-2-27 21:38 您好 IRC曲线是单调下降的 然后我把端点优化后确实得到的是我的反应物 |
sai77 发表于 2024-2-28 08:45 牛啊,这种问题都没人问的吗?虽然算是一个比较常见的现象,但能发表出来是我没想到的 |
sobereva 发表于 2024-2-28 06:24 好的sob老师 下次一定注意 |
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