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A的Cl原子不可能和B的-COOH共价结合,又没发生化学反应 “分子间转移电荷量最大” 不构成判据 应当称为结合能最负避免歧义 虽然可以按下文用Multiwfn考察分子表面静电势,根据显著的表面静电势正、负位点去对A、B进行匹配来考察此问题,但这种做法的靠谱程度、原理的合理性远比不上用GROMACS做分子动力学研究。光是用量化程序对复合物算算结合能,考虑得也明显不周全(构象问题、周围其它分子的存在、动态效应,都是完全没法忽视的)。 使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示) http://sobereva.com/443(http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html) 使用Multiwfn的定量分子表面分析功能预测反应位点、分析分子间相互作用 http://sobereva.com/159 |
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