求助gromacs能量最小化报错文件匹配，怎么解决呢

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发布时间: 2024-3-4 10:19

执行命令gmx grompp -f nvt.mdp -c em.gro -r em.gro -p ben.top -o nvt.tpr报错如下图：谢谢大家。

回复 Reply

@LWS 发表于 Post on 2024-3-5 15:00:14

好的，谢谢老师。

sobereva 发表于 Post on 2024-3-4 12:10:20

别自己在标题里手写[GROMACS]这种标签，这次给你改了，以后注意

检查top里的[molecules]字段，必须和gro文件里各类分子数、顺序都对应

@LWS 发表于 Post on 2024-3-4 11:15:00

看见了。谢谢，但是我不知道怎么解决这个问题呢。

dzdhp 发表于 Post on 2024-3-4 10:56:13

提示不是很明显吗，你gro文件里面的的原子数跟top里面对不上

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