计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

GAMESS计算EDA输入文件问题

查看数: 511 | 评论数: 6 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2024-3-5 09:50

正文摘要:

各位老师好,在用GAMESS算EDA的时候,我想算下图上下两个结构的相互作用能,分为两个片段应该怎么编辑呢?

回复 Reply

zjxitcc 发表于 Post on 2024-3-5 13:22:46
本帖最后由 zjxitcc 于 2024-3-5 13:37 编辑
morningya 发表于 2024-3-5 10:58
我的是直接从GAMESS官网下载的然后找人安装的,意思是现在用不了GKS-EDA吗。因为我就是接触一下GAMESS的 ...

当然可以用,毫无问题。有了inp文件,既可以在自己机器上算,也可以到XACS云平台上算。完全不需要自己写inp文件(也不建议手写),基组和片段定义十分繁琐易错,GAMESS里一个基组名称可能并不对应Gaussian等常见程序中的常见基组。

只要是个正常人会点鼠标创建gjf文件即可:使用frag_guess_wfn小程序自动调用Gaussian做计算(g09/g16都支持)、产生GKS-EDA输入文件,内含写好的关键词、坐标、收敛好的轨道、片段和基组信息,提交给GAMESS后每个SCF计算可立即收敛,例子见https://jeanwsr.gitlab.io/mokit-doc-mdbook/chap5-3.html

在GaussView里点Tools->Atom Groups即可划分片段。而且借助frag_guess_wfn小程序只需改变gjf文件中的EDA名称,即可进行多种EDA方法的计算,不需要记忆各种EDA方法的关键词和计算步骤,不需要关心哪个程序的SCF收敛性问题(因为产生的输入文件还含有收敛的轨道信息)。

sobereva 发表于 Post on 2024-3-5 11:44:36
morningya 发表于 2024-3-5 10:54
老师,我看您的帖子上面要求是G16,但是我们实验室高斯是09版本的,请问也可以用吗

不一定会失败,可以实测。只能说G16肯定能行
morningya 发表于 Post on 2024-3-5 10:58:43
paramecium86 发表于 2024-3-5 10:33
使用的GAMESS有没有重新编译过?GKS-EDA需要去厦大网站下载XEDA,然后patch一下原始的gamess,然后再重新编 ...

我的是直接从GAMESS官网下载的然后找人安装的,意思是现在用不了GKS-EDA吗。因为我就是接触一下GAMESS的操作,对EDA类型没有要求,老师,如果我把edatyp=gks删掉能算吗
morningya 发表于 Post on 2024-3-5 10:54:56
sobereva 发表于 2024-3-5 10:37
如果你有Linux版Gaussian的话,推荐用sobEDA,输入文件非常好写,计算还非常快
使用sobEDA和sobEDAw方法做 ...

老师,我看您的帖子上面要求是G16,但是我们实验室高斯是09版本的,请问也可以用吗
sobereva 发表于 Post on 2024-3-5 10:37:01
如果你有Linux版Gaussian的话,推荐用sobEDA,输入文件非常好写,计算还非常快
使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html
paramecium86 发表于 Post on 2024-3-5 10:33:17
本帖最后由 paramecium86 于 2024-3-5 10:34 编辑

使用的GAMESS有没有重新编译过?GKS-EDA需要去厦大网站下载XEDA,然后patch一下原始的gamess,然后再重新编译 把XEDA编译进GAMESS才可以用。或者直接使用他们的在线平台也可直接做GKS-EDA

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 10:04 , Processed in 0.199527 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list