计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register

求助gromacs中使用grompp指令在md中无法得到tpr文件,gromacs软件也不报错

查看数: 547 | 评论数: 5 | 收藏 Add to favorites 0
关灯 | 提示:支持键盘翻页<-左 右->
    组图打开中,请稍候......
发布时间: 2024-3-6 14:44

正文摘要:

本帖最后由 不想延毕 于 2024-3-6 14:44 编辑 如图,利用charmm-gui建立的膜体系,在执行能量最小化以及nvt,npt的过程都能正常进行,在利用grompp命令整合参数时出现了这种情况,执行了几个步骤后就自动中断并让 ...

回复 Reply

lyZhu 发表于 Post on 2024-10-20 21:46:18
你好,我遇到同样问题,解决方案如下:使用2018cpu版本来grompp,再回到2020gpu版本来计算即可。

tip:1。高版本能兼容低版本,但注意力场里的参数要同步到cpu版本中去。2.我cpu版本从未出现上述问题,但gpu版本屡屡出现grompp后无输出问题。
不想延毕 发表于 Post on 2024-3-6 16:00:35
sobereva 发表于 2024-3-6 14:59
用linux版再试。Windows系统可以用vmware虚拟机装linux

谢谢sob佬,我去研究研究
不想延毕 发表于 Post on 2024-3-6 16:00:08
牧生 发表于 2024-3-6 15:05
考虑把中文路径改成全英文,且没有空格,没有符号的路径

改全英文路径也没有解决问题,准备试试linux系统
牧生 发表于 Post on 2024-3-6 15:05:07
考虑把中文路径改成全英文,且没有空格,没有符号的路径

202403061504499886..png (138.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)

202403061504499886..png
sobereva 发表于 Post on 2024-3-6 14:59:43
用linux版再试。Windows系统可以用vmware虚拟机装linux

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 11:43 , Processed in 0.593396 second(s), 32 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list