wzkchem5 发表于 2024-3-10 19:19 感谢您的回复,老师您说的非常正确。 我在第一次找过渡态的时候是按照Lu(H2O)3+ + DOTA4- -> [Lu(DOTA)(H2O)]- 的反应式来的,但是出现仍然出现了振荡,我以为是体系太复杂导致的。 因为我的目的是想通过过渡态的研究来比较不同配体的络合动力学,所以想着简化一下分子可能对于体系的过渡态优化有帮助(还是说越和真实情况相符越有利呢?)。 那我先按照老师的方法,以他实际的过程为准来找一下过渡态,再次感谢老师的帮助! |
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计算过渡态的时候考虑水分子了吗? 结合反应是在水里进行的,而金属第一配位层的溶剂分子必须显式描述。所以不能按Lu3+ + DOTA4- -> [Lu(DOTA)]-来算,至少也要按[Lu(H2O)n]3+ + DOTA4- -> [Lu(DOTA)]- + nH2O来算,其中n是多少自己查研究Lu3+(aq)的文献。要算得准确,还要考虑DOTA4-和水分子形成的氢键,以及[Lu(DOTA)]-的Lu是否有多余配位点和水配位 |
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