sobereva 发表于 2024-3-20 23:24
你没点到键径上，就不可能有那么大的index号

好的谢谢老师

你没点到键径上，就不可能有那么大的index号

sobereva 发表于 2024-3-18 20:49
都明确说了
使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图（含视频演示）
http://sobereva.com/445（ht ...

老师我主要想看一下里面的BF4离子和外面原子相互作用的强弱

sobereva 发表于 2024-3-18 20:49
都明确说了
使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图（含视频演示）
http://sobereva.com/445（ht ...

老师还是有问题，我是这样操作的
2  //拓扑分析
2  //以每个原子核为初猜搜索临界点
3  //以每一对原子中点为初猜搜索临界点
8  //产生键径
-5  //处理键径
8  //只保留连接两个片段间的键径和对应的BCP而删除其它的
286-290 //中心分子的原子序号
1-5,38-47,67-76,95-104,175-184,189-218,233-262  //其余分子的原子序号
y  //连接两个片段以外的键径已被删除，这里输入y也删除它们对应的BCP
6  //把当前键径导出为paths.pdb
0  //返回
-4  //修改临界点
2  //删除某些临界点
5  //删除对当前没意义的(3,+1)型临界点
6  //删除对当前没意义的(3,+3)型临界点
0  //返回
6  //把临界点导出为CPs.pdb
然后点击键临界点还是index很大

都明确说了
使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图（含视频演示）
http://sobereva.com/445（http://bbs.keinsci.com/thread-11079-1-1.html）