重复plumed教程出现一些疑问

正文摘要:

请教一下各位老师，我在重复plumed的评估自由能的过程中出现了一些问题，如图所示。这个教程是通过pdb文件进行的模拟，我使用的是gro文件，itp文件使用sobtop生成。正常情况下得到的结果我的理解应该是左右对称的， ...