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关于油水混相的coulombtype设置问题

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deanvs

发布时间: 2024-3-21 18:31

正文摘要:

各位老师好，我现在在做添加表面活性剂的油水混相、乳化模型，初始模型是油（十二烷，ATB下载）水、表面活性剂（SDS，从ATB上下的）、醇（戊醇充当助剂，都是从ATB整的）模型和拓扑文件都在附件中（gro文件太大压缩 ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-3-21 21:21:59

先搞清楚cutoff、Ewald、PME都是什么，北京科音分子动力学与GROMACS培训班的“分子动力学的基本原理与算法”部分详细讲了
如果你要模拟充满盒子的周期性体系，不要用PME以外的。在此前提下，如果遇到什么问题，该怎么解决怎么解决，参考http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ8的解决思路和排查方式

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