乐平 发表于 2024-5-4 16:31 对的，我发的第一个链接中说了这个问题， Intel MPI 的有些版本下Slurm跟mpirun不兼容，OpenMPI的有些版本下Slurm跟srun不兼容。我的意思是想解释这个问题不是AMD CPU的锅，而是MPI跟Slurm的兼容性问题...比如编译个Intel MPI 版本的VASP测试，或者把srun --mpi=pmi2跟mpirun都试试。 |
乘风万里 发表于 2024-4-19 11:01 借楼讨论一下 OpenMPI 官网上的说法似乎跟 srun 有矛盾。OpenMPI 官方网推荐用 mpirun 来提交任务，反而不建议用 srun 来提交任务。 链接如下 https://docs.open-mpi.org/en/v5.0.x/launching-apps/slurm.html 
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chantau 发表于 2024-4-22 15:55 如果他们调不好的话肯定要退货换成intel的 |
本帖最后由 chantau 于 2024-4-23 14:12 编辑 lue611 发表于 2024-4-13 17:24 厂商的责任心要画一个大大的问号好吧 |
乘风万里 发表于 2024-4-19 11:01 试过这个，核心分配也是正常的，但是计算速度似乎和一个核心在跑差不多。。。 |
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本帖最后由 乘风万里 于 2024-4-19 11:14 编辑 你认为是你用的mpirun的原因，正常应该是srun --mpi=pmi2 vasp_gam。之前有人问过我类似的问题，改成srun --mpi=pmi2 可以解决。而且AMD的VASP兼容性没有大的问题，因为目前大的公司采购的大多数都是AMD的服务器，比如各种xx云，我在上面运行各种VASP还没发现你说的问题。 具体MPI任务以什么方式启动，需要看你Slurm跟MPI的兼容性。 参考资料： 1. https://hpc-uit.readthedocs.io/e ... nning_mpi_jobs.html 2. https://hpclib.com/hpc/Scheduler/Slurm/mpi_guide.html |
| 讨论技术问题就事论事，别扯到个人上。保持理性、技术层面的交流，违规者禁言处理 |
Entropy.S.I 发表于 2024-4-13 12:12 amd工程师是厂商联系的，他们的公司规模不算小，肯定能联系到比你水平强的 然后是，厂商在amd和intel上一起测试，发现就是amd机子会堆核心 再然后，我用oneapi在amd上编译vasp，发现问题解决，不堆核心 是个正常人都会怀疑openmpi和amd好吧 |
本帖最后由 Entropy.S.I 于 2024-4-13 12:16 编辑 lue611 发表于 2024-4-13 10:29 压根不是ompi和CPU的问题，和CPU一点关系都没有。对你这种信口胡诌之人我没兴趣分享技术，更没有义务分享我靠自己本事研究出的解决方案。分享不分享只看心情，别人我可能会分享，但不会给你分享。 “AMD工程师”分三六九等，你能轻易联系到的都不是有技术实力的人，甚至可能只是某个外包/代理商的人，给几个糊弄外行的借口就敷衍过去了。我又不是没接触过这些人。 |
本帖最后由 lue611 于 2024-4-13 10:43 编辑 Entropy.S.I 发表于 2024-4-11 23:38 要不要给你截图证明确实是amd工程师说的？ 我发现你回复我的每个帖子都只是装了个逼然后就跑了，啥干货也没有，而我虽然菜提不出解决方法吧，但是好歹把自己的经历分享出来了，并且指出了问题 上次我诚心提问你还骂我一句intel信徒，也没告诉我什么干货 |
| 这个问题我已经解决，方法非常简单，不需要任何非常规操作。实际上本来就不应该有这个问题。只不过鉴于某些人的信口胡诌和搞扩大化，我不会轻易公开解决办法。 |
Sunjeaser 发表于 2024-4-10 11:01 以为搞定了实际没搞定，就是amdcpu的兼容性太垃圾，暂时无解 |
本帖最后由 abin 于 2024-4-10 12:16 编辑 lue611 发表于 2024-4-10 10:20 主板会有设定， 可以将两颗处理器，划定为几个numa 域。 如果slurm位置没有问题， 使用per-socket ，也就是一个任务，分配一个物理处理器， 可能就没有问题了。 另一方面，AMD双路平台，一套价格不低， 意味着利润空间不低…… 如果有利，商业合作当然愿意选择利润空间高的做推广。 这很符合市场行为。 per-socket 应该是总在脚本中…… 具体看一下手册。我可能有拼写错误。 一般而言，除部分设定之外，调度系统是以用户脚本中的设定为准的。 |
| 参与人数Participants 1 | eV +1 | 收起 理由Reason |
|---|---|---|
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| + 1 | 谢谢 |
lue611 发表于 2024-3-25 17:40 你好，我最近也遇到相同的问题，请问这行命令是如何使用呢？例如我想用24核计算vasp 那我的命令行应该输入:mpirun --map-by numa -np 24 vasp_std& 是这样子操作么，期望得到解答。 |
| 更新一下，amd工程师说是openmpi和amd有兼容性问题。。。千万别推amd了，人麻了 |
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