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高斯算ESP电荷,同种原子的电荷不唯一,求助

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发布时间: 2016-11-6 10:42

正文摘要:

根据文献内容,利用高斯软件求算分子的ESP电荷。先用Gaussianview限制分子的对称性为D3h(见下图),然后生成gjf文件进行计算。按理说,分子中的6个Cu应该处于同一种化学环境中,可是结果中的ESP电荷却是三种不同的 ...

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小瓶子 发表于 Post on 2016-11-9 21:40:35
非常感谢sob老师,我再好好读一下文章,谢谢啦!
sobereva 发表于 Post on 2016-11-9 20:50:27
小瓶子 发表于 2016-11-9 20:00
还想请问sob老师,在上面那个分子中,对于苯环上连接H的C原子,文献得到的ESP电荷是负值(-0.014),而我计 ...

拟合静电势电荷用很多不同计算方法,看这里
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=221
即便是同种拟合静电势电荷计算方法,格点设置不同、静电势计算级别和方法的不同、几何结构的细微不同等等,都会造成数值的不同。你的数值和文献的数值虽然符号不同,但差异很小,都很接近0,所以姑且可当成一样。
小瓶子 发表于 Post on 2016-11-9 20:00:35
还想请问sob老师,在上面那个分子中,对于苯环上连接H的C原子,文献得到的ESP电荷是负值(-0.014),而我计算所得的ESP电荷为正值(0.011),请问老师可能是什么原因呢?谢谢老师啦!
小瓶子 发表于 Post on 2016-11-7 10:23:22
谢谢sob老师指点
sobereva 发表于 Post on 2016-11-6 20:57:47
小瓶子 发表于 2016-11-6 16:12
Cu半径本来只写了一次,但是优化结果提示,缺少Cu的范德华半径,故此又加了一次半径,然后就可以顺利优化得 ...

没有那种参数,至多只能取个平均
小瓶子 发表于 Post on 2016-11-6 16:12:42
Cu半径本来只写了一次,但是优化结果提示,缺少Cu的范德华半径,故此又加了一次半径,然后就可以顺利优化得到结果了。
听从sob老师的建议,查看了mulliken电荷,发现结果分子中的O原子有四种电荷(但我认为O应该只有一种,即一种电荷),而Cu只有一种电荷(Cu有一种,这个没问题)。请问在这种情况下,可以调整参数使得同种原子的ESP电荷保持一致吗?谢谢!
sobereva 发表于 Post on 2016-11-6 12:39:42
Cu 1.32没必要写两次

要想得到相同的拟合静电势电荷,必须原子的化学环境严格相同(不同的Cu与其它各个原子距离一致),而且电荷分布也一致(若波函数低于几何结构的对称性,此时显然没戏)。而且一般的拟合静电势方法由于格点分布原因,哪怕上两条都满足,等价的原子结果也可能因为数值因素而不同(G09里支持将格点连续化的拟合方法倒是应该没这个问题)。

建议你先看看这些Cu的mulliken电荷是否相同。这都不同的话,CHELPG电荷注定不可能相同。

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