分子模拟达不到预期怎么办，上下两层总是跑不到一起

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发布时间: 2024-3-24 20:20

各位老师好，最近在做分子动力学时，怎么跑也达不到预期,这个是起始，我是想把它跑成类似于这种的，但上下两层总是跑不到一起，最终变成这样是哪里设置错了吗?

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lixiaoguai 发表于 Post on 2024-12-25 21:47:00

您的这个问题解决了吗，我的疑问也是跟您的类似，想要将二者进行一个接触反应。我的是将fe与naoh溶液进行一个反应

78b6ec7e1eae5634ad67277c38e5abd.png (73.54 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)

sobereva 发表于 Post on 2024-3-25 12:35:19

跑NPT，等盒子压紧实了，然后再扩出真空区跑NVT

ilovelr 发表于 Post on 2024-3-25 09:59:11

先给一个外力，把上下两层拉到一起，在取消外力跑NVT或者NPT

牧生 发表于 Post on 2024-3-24 21:05:02

试试右键，显示方式in cell。。看起来你想跑nvt，理由何在？

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