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Gromacs结果可视化分析出现部分氨基酸和小分子异常漂移是什么原因?

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发布时间: 2024-3-26 21:56

正文摘要:

如题,新手刚开始做Gromacs,跟着教程做完之后,用生成的MD.tpr文件和MD.xtc文件在Chimera中进行可视化分析。为了便于观察小分子和蛋白的100ns内的结合状态,离子和水分子已经被我删去。在chimera的MD movie模块运行 ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-6-12 02:57:03
a1207732382 发表于 2024-6-11 09:49
社长,我也是新手,也遇到这个问题,请问下看了轨迹之后应该怎么做?

把问题描述具体,什么程序怎么看的、看到的是什么样
a1207732382 发表于 Post on 2024-6-11 09:49:33

社长,我也是新手,也遇到这个问题,请问下看了轨迹之后应该怎么做?
sobereva 发表于 Post on 2024-3-27 00:39:26
用VMD看轨迹

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