加入抗衡例子后无法产生gro文件

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发布时间: 2024-3-27 14:45

请教一下各位老师，我最近在用GROMACS(2020.6_GPU)模拟A分子和B分子的自组装，溶剂是DMSO，A和B分子的拓扑文件都是通过sobtop得到的，DMSO的拓扑文件通过antechamber得到，溶剂盒子通过NPT模拟得到。但是在使用指令 ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-3-28 01:18:43

antechamber根本没法产生GROMACS的拓扑文件。没有理由不也用sobtop产生DMSO的拓扑文件

OPLS-AA的ions.itp哪能跟GAFF力场混用，缺乏基本力场常识

–neutral的–必须写成-

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