sobereva 发表于 2024-4-1 15:20 好的,谢谢老师我尝试一下 |
使用IRI方法图形化考察化学体系中的化学键和弱相互作用 http://sobereva.com/598(http://bbs.keinsci.com/thread-23457-1-1.html) 里面说了 如果你只希望IRI展现弱相互作用区域,而不想把成键区域也表现出来,可以在Multiwfn做完IRI分析后选择屏幕上的选项9 Screen out covalent bond regions (set IRI to 100 for regions with sign(lambda2)rho < -0.1 a.u.)(此选项在2024-Mar-29及以后更新的Multiwfn里才有),之后sign(λ2)ρ小于-0.1 a.u.的区域内的IRI值就会被设为一个很大的值100。这样做的理由是形成化学键的区域通常电子密度都较大,因而sign(λ2)ρ比-0.1 a.u.更负,此区域的IRI设成很大的值后再绘制等值面图时就看不到这块区域了。之后你再导出func1.cub和func2.cub、用IRIfill.vmd脚本作图,就会发现成键区域确实已经看不见了,对苯酚的例子如下所示 |
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