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gromacs真空模拟聚合物出现真空区域没有自发消除问题

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发布时间: 2024-4-4 11:11

正文摘要:

步骤是先升温后退火模拟，都使用了压浴，拓扑文件使用sobtop生成

回复 Reply

sobereva 发表于 Post on 2024-4-4 16:20:54

把压浴时间常数设小、让压浴作用效果表现得更显著，也可以暂时性加大可压缩系数，以尽可能在较短时间内令盒子尺寸收缩合适。等真空区消差不多了，再改成原本的压浴参数。

Lacrimosa 发表于 Post on 2024-4-4 13:56:34

一般延长模拟时间就能解决了

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