羟基化SIO2后H原子不被识别

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发布时间: 2024-4-7 21:25

各位老师，我刚学习GROMACS不久，想通过sobtop创建top文件，我的模型是一个羟基化后的SIO2球模型，但是sobtop无法识别H原子，麻烦各位老师指点一二，感激！

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Dalin 发表于 Post on 2024-4-8 12:02:30

sobereva 发表于 2024-4-8 03:19
我这里sobtop全都识别了

感谢sob老师，我找到问题原因了，因为我把assign_AT.dat文件没有放在sobtop程序的目录里所以导致无法识别。

sobereva 发表于 Post on 2024-4-8 03:19:40

我这里sobtop全都识别了

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