为什么自由基反而远离富勒烯？

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发布时间: 2024-4-8 17:31

本帖最后由 zhangs 于 2024-4-8 20:57 编辑请教下各位，我用GROMACS对富勒烯和自由基跑了动力学，理论上应该是自由基贴近富勒烯，但动力学结果却是自由基远离富勒烯，无论是有无PBC均不会靠近，不知为何？请各位 ...

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zhangs 发表于 Post on 2024-6-11 21:41:37

七尺贱发表于 2024-4-19 21:25
如果只是一个富勒烯和一个自由基分子，用CP2K跑一下就行

大佬你好，请问在cp2k上用什么方法和基组跑啊

sobereva 发表于 Post on 2024-4-20 07:57:17

zhangs 发表于 2024-4-19 22:35
老师，cp2k可以模拟出靠近的过程吗？

可以
而且还可以直接给初速度让自由基打向富勒烯

北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html）里面都有相关的现成例子

sobereva 发表于 Post on 2024-4-20 07:52:46

zhangs 发表于 2024-4-19 17:07
老师，降低温度还是不太理想，请问这个势函数是通过力场呈现吗？

显然势函数体现在力场上

zhangs 发表于 Post on 2024-4-19 22:35:13

七尺贱发表于 2024-4-19 21:25
如果只是一个富勒烯和一个自由基分子，用CP2K跑一下就行

老师，cp2k可以模拟出靠近的过程吗？

七尺贱 发表于 Post on 2024-4-19 21:25:59

zhangs 发表于 2024-4-19 17:07
老师，降低温度还是不太理想，请问这个势函数是通过力场呈现吗？

如果只是一个富勒烯和一个自由基分子，用CP2K跑一下就行

zhangs 发表于 Post on 2024-4-19 17:07:01

sobereva 发表于 2024-4-9 12:11
温度太高，热运动导致克服了吸引势作用，或者当前势函数不合理
如果你期望的是反应发生，GROMACS没法模拟 ...

老师，降低温度还是不太理想，请问这个势函数是通过力场呈现吗？

sobereva 发表于 Post on 2024-4-9 12:11:03

温度太高，热运动导致克服了吸引势作用，或者当前势函数不合理
如果你期望的是反应发生，GROMACS没法模拟，不支持反应力场

zhangs 发表于 Post on 2024-4-9 11:47:20

GoldenBaby 发表于 2024-4-9 08:19
你是否需要的是这个？
http://sobereva.com/576

感谢您的回答，对我有很大的帮助

GoldenBaby 发表于 Post on 2024-4-9 08:19:55

你是否需要的是这个？
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