求助：DSSP计算氢键数量的疑惑

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发布时间: 2024-4-8 19:40

请问如何通过DSSP得到蛋白质的氢键总数量？ Dssp对于氢键的定义为：当键能＜-0.5kcal/mol定义为氢键，如图1 Dssp文件格式为：先给出各种氢键的total number，再给出每个残基对应的键能，如图2。其中N-H-->O的定 ...

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sobereva 发表于 Post on 2024-4-9 12:16:52

VMD直接就可以用measure hbonds命令统计，参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）这页ppt：

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