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有关Multiwfn结合VMD进行弱相互作用分析的有关问题

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发布时间: 2016-11-16 10:44

正文摘要:

老师,请问在用Multiwfn结合VMD进行弱相互作用分析的时候,出现了下图的情况,该怎么分析呢? 没有出现相应的氢键等值面,是不是代表相互作用很强以至于程序认为其已经成键了呢?

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清岚 发表于 Post on 2016-11-16 15:17:20
好的,明白了,谢谢老师!
sobereva 发表于 Post on 2016-11-16 13:04:28
注意合理选择发帖的板块

你图中这种情况氢离两个氧原子都很近,说明氢键极强,甚至有明显共价作用,这种情况默认设置下RDG等值面不会出现,因为相互作用区域电子密度已经比默认的RDGmaxrho参数0.05更大而被截掉了。
这种情况适合结合讨论化学键的方式讨论,如键级、ELF、AIM分析等。

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