求助：离子晶体表面吸附位点的确定

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发布时间: 2024-4-19 16:42

本帖最后由 qzupc 于 2024-4-19 17:06 编辑各位老师好，如题，我想计算碳酸钾表面吸附一些单一小分子的吸附能，所建模型如下我目前考虑的吸附位点是分别对C、O、K的顶位、桥位、孔位上方3埃作为初始位点来做吸 ...

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qzupc 发表于 Post on 2024-4-22 08:52:51

sobereva 发表于 2024-4-22 06:21
可以

好的，多谢社长

sobereva 发表于 Post on 2024-4-22 06:21:37

qzupc 发表于 2024-4-21 13:11
社长，请问能否这样设置，我在初始模型中人为加了15埃的真空层，计算时选XY周期性，然后把inp文件中的Z坐 ...

可以

参与人数 Participants 1	eV +2	收起理由 Reason
qzupc	+ 2	谢谢

qzupc 发表于 Post on 2024-4-21 13:11:42

sobereva 发表于 2024-4-21 05:06
你在Multiwfn里设成XY二维周期性后，Z方向的盒子尺寸总是被Multiwfn自动根据ppt里的做法确定，而不会延用 ...

社长，请问能否这样设置，我在初始模型中人为加了15埃的真空层，计算时选XY周期性，然后把inp文件中的Z坐标换成输入文件里的，这样做几何优化对结果有影响吗

qzupc 发表于 Post on 2024-4-21 08:48:32

sobereva 发表于 2024-4-21 05:06
你在Multiwfn里设成XY二维周期性后，Z方向的盒子尺寸总是被Multiwfn自动根据ppt里的做法确定，而不会延用 ...

好的，感谢社长回复

sobereva 发表于 Post on 2024-4-21 05:06:49

qzupc 发表于 2024-4-20 21:51
非常感谢社长的回复，那我是在初始模型已经人为加了15埃厚度的真空层了，这种也是需要让他再自动额外确定 ...

你在Multiwfn里设成XY二维周期性后，Z方向的盒子尺寸总是被Multiwfn自动根据ppt里的做法确定，而不会延用输入文件里的，这可有效避免输入文件存在不当的盒子尺寸。只有周期性方向的盒子尺寸才会被Multiwfn延用。

想用三维周期性+偶极校正随你。

qzupc 发表于 Post on 2024-4-20 21:51:22

sobereva 发表于 2024-4-20 08:53
北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html）里都非常明确讲了 ...

非常感谢社长的回复，那我是在初始模型已经人为加了15埃厚度的真空层了，这种也是需要让他再自动额外确定真空层厚度吗，我看讲义里提到二维体系也可以用XYZ周期性加Z方向的偶级校正，我这个体系是否合适这样设置呢？

sobereva 发表于 Post on 2024-4-20 08:53:27

北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html）里都非常明确讲了

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